A pesar de que Subnautica 2 no cuenta oficialmente con una consola de depuración, los modders han encontrado una solución. Al instalar ciertos mods, los jugadores pueden acceder a comandos de consola que permiten activar trucos como el modo dios, la aparición instantánea de objetos y desbloquear todas las recetas y planos.
Para acceder a esta consola, se debe descargar UE4SS y seguir varios pasos en la carpeta de instalación del juego. Una vez hecho esto, al presionar F2, los jugadores podrán ver una serie de comandos en pantalla que facilitan la manipulación de elementos del juego, como la invención de recursos y el ajuste de sistemas de supervivencia.
Entre los comandos disponibles se encuentran god que evita daño y necesidad de recursos, invisible que impide que las criaturas hostiles te vean, y unlock all para adquirir todas las recetas y planos. Aunque hay comandos que ya están en el juego pero deshabilitados, se espera una actualización oficial que los active.
El equipo de Unknown Worlds ha confirmado que se planean actualizaciones que incluirán opciones de consola y funciones de cámara, buscando asegurar que todos los jugadores, tanto de consola como de PC, puedan utilizarlas.