En la última misión de Marathon, los jugadores enfrentan el contrato de prioridad Order/Chaos, que implica desactivar alarmas y acceder a datos encriptados en Dire Marsh. Este desafío requiere completar tres objetivos en un único intento, llevando a los jugadores de un extremo a otro del mapa.
Para iniciar la misión, es necesario interactuar con un terminal que activa la aparición del Comandante de Seguridad desde una nave de descenso roja, acompañado de refuerzos. Al eliminar al Comandante, se deben recoger sus credenciales, indicadas por un ícono de misión amarillo en el suelo.
El siguiente paso consiste en descargar datos de un terminal situado en el sur de la zona de Mantenimiento. Aunque se podría pensar que está en la sala de control, en realidad, se encuentra en el centro del hangar, al sur, justo debajo del pasillo que da al pantano.
Para una ruta más segura, se sugiere desplazarse hacia el sur desde Complex, siguiendo la parte inferior del mapa. Al interactuar con el terminal en el hangar, la misión se considera completada, aunque no es necesario extraer a los personajes con vida. Si no se logran cumplir los tres objetivos en una sola partida, se deberá reiniciar el contrato.