En Marathon, los jugadores deben recolectar la mayor cantidad de botín posible en cada partida, evitando morir para no perderlo. Una de las maneras de obtener más loot es a través de las Lockbox Keys, necesarias para abrir cofres en áreas específicas. Aunque estas llaves son escasas, pueden encontrarse en contenedores o como objetos sueltos en el entorno.
Para adquirir Lockbox Keys, los jugadores pueden optar por comprarlas tras haber desbloqueado el perk Locksmith de CyAc en el rango 4, lo que requiere 2,500 créditos. Con el perk activo, es posible comprar llaves en la Armería antes de una partida. Los materiales necesarios para la compra de las llaves varían, incluyendo elementos como Sparkleaf y Dermachem Packs.
Una vez en posesión de las llaves, se pueden usar para abrir diferentes cofres en las habitaciones marcadas por flares rojos. Sin embargo, la cantidad de llaves disponibles puede no ser suficiente para abrir todos los cofres, lo que convierte la experiencia en un juego de azar. Los cofres suelen contener valiosos materiales de salvamento, créditos y consumibles.